(货号:WLE5003)
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原理概述:
本试剂盒基于一种常温恒温核酸快速扩增技术:在常温恒温下,重组酶和引物形成蛋白/单链核苷酸的复合体Rec/ssDNA,在辅助蛋白和单链结合蛋白SSB的帮助下,侵入双链DNA模板;在侵入位点形成D-loop区域,并开始对DNA双链进行扫描;待找到与引物互补的目的区域后,复合体Rec/ssDNA解体的同时,聚合酶也结合到引物的3’末端,开始链的延伸。本试剂盒在39 ºC下,依赖核酸外切酶的作用,加入根据模版设计的特异的分子探针,使用荧光监测设备能实现对目标片段扩增过程的实时监控。
引物设计:
建议使用长度在30-35 bp的引物,引物过短会影响扩增速度和检测灵敏度;引物设计避免形成二级结构而影响扩增;扩增子长度建议在150-300 bp,通常不超过500 bp。
荧光探针设计:
探针序列不与特异性引物识别位点重叠,长度为46-52 nt,序列避免回文序列、内部二级结构和连续的重复碱基。探针共有四个修饰位点:距离5’端的≥35 nt的中部位置标记一个dSpacer(四氢呋喃,THF),作为核酸外切酶的识别位点;THF位点的上游标记一个荧光基团,下游标记一个粹灭基团,两个基团的间距为2-4 nt;THF距离3’末端≥15 nt,并且3’末端标记一个修饰基团,例如胺基、磷酸基团或C3-Spacer。
试剂盒组成:
100T/盒
组成 | 含量 |
C buffer | 1 mL×2管 |
L buffer | 500 μL×1管 |
P-core | 1.2 mL×1管 |
E-core | 60 μL×1管 |
B buffer | 300 μL×1管 |
使用说明书 | 1份 |
试剂盒储存:
运输条件:低温运输;
储存条件:储存温度 ≤ -20 ºC,避光保存,避免重压、反复冻融;
操作步骤:提前将试剂盒所需组分取出,冰上或低温下融化(C buffer可室温融化),震荡混匀。
1) 向无菌0.2mL PCR管中加入20 μL C buffer、5 μL L buffer;
2) 加入2 μL上游引物、2 μL下游引物和0.6 μL探针,再加入1.5μL dNTPs(10 mM);
3) 向反应管中加入12 μL P-core和0.6 μL E-core,(步骤1~3可以混合后再分装至反应管中);
4) 向反应管中加入3.8 μL核酸模板;
5) 最后向反应管中加入2.5 μL B buffer并充分混合(加入B buffer反应立即被启动);混匀后,将反应液甩(或快速离心)至管子底部,然后立即将反应管放入荧光检测设备中。荧光检测程序设置为:恒温39 ºC;每30 s采集一次荧光信号;反应时间20 mins。
注:如使用ABI系列PCR仪,请务必于passive reference和quencher处均选择“none”。
体系配制
组分 | 体积(μL) |
C buffer | 20
5 |
L buffer | |
P-core | 12 |
E-core | 0.6 |
dNTPs(10 mM) | 1.5 |
下游引物(10 μM) | 2 |
下游引物(10 μM) | 2 |
探针(10 μM) | 0.6 |
DNA模板 | 3.8 |
B buffer | 2.5 |
总体积 | 50 |
N:阴性对照; P:正对照 |
注意事项:
- 为保证液体试剂组分活性,请保证储存温度 ≤ -20 ºC;试剂使用时请保持低温,避免高温放置过长时间;
- 在进行反应时请注意避免微量核酸染,并设置空白对照实验组。